Nell'antica via del Seminario abitava il nobile Giacobino Rainerotti che, essendo in via di estinzione la sua famiglia, nel 1517 dispose per testamento che le sue case e proprietà fossero destinate alla fondazione di un convento di suore osservanti sotto il titolo di San Bernardino dell'ordine di San Francesco e alla costruzione di una chiesa dedicata a San Bernardino da Siena, uno dei più celebri propagatori dei Minori Osservanti di San Francesco. La prima pietra della chiesa fu posta nel 1521 e le monache presero possesso del convento nel 1525. Con l'avvento di Napoleone il convento venne soppresso (con decreto del 25 aprile 1810) e passò al demanio. Nel 1832 sull'area dell‟ex-convento di San Bernardino, si diede inizio alla costruzione del nuovo Seminario diocesano, mentre la chiesa rimase al servizio dei chierici e del popolo.